Entre todas las lineas de investigación que Manu tiene, una es entender cuales son los factores asociados a la RNA pol II y ver si estos cambian cuando esta hiperfosforilada (cuando la célula es irradiada con luz UV) o si esta hipofosforilada(en condiciones normales).
Para esto lo que va a hacer es una inmunoprecipitacion, que conciste en que un anticuerpo por un lado identifica a la Pol II, junto con sos factores asociadas, y depues ese mismo anticuerpo reconozca un peso(literalmente) y este haga que el anticuerpo junto con la RNA Pol II precipite junto con sus factores. De esta forma se "purifica" a la enzima/proteína en cuestión.
Luego mediante la espectroscopia de masa, se pude determinar que proteínas están asociadas a la pol II. Depuse se puede ver cual es la función de cada factor respecto a la velocidad de elongación de la RNA Pol II.
para esto, manu necesita que el anticuerpo que use sea muy muy especifico, y en el western de separación de la RNA Pol II del resto de la proteína, no de manchas, y de lindo.
por eso hoy hicimos un western de la misma muestra pero con distintos anticuerpos.
la semana que viene les contamos los resultados!!
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